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| Taxon | Collector | Date | Country | State/Province | Locality | Type Status | Barcode | Notice | ||
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| Acalypha diversifolia Jacq. | R. M. Rueda 1030 | 09 Aug 1992 | Ecuador | Napo | Tena (Canton). Estación Biologica Jatun… | — |
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| Acrostichum aureum L. | R. M. Rueda 16908 | 09 Mar 2002 | Nicaragua | Río San Juan | Reserva Indio-Maiz, entre San Juan… | — |
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| Adiantum latifolium Lam. | R. M. Rueda 9540 | 07 Dec 1998 | Nicaragua | Río San Juan | El Castillo Mun. Reserva Indio-Maiz;… | — |
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| Adiantum petiolatum Desv. | R. M. Rueda 15110 | 22 Nov 2000 | Nicaragua | Río San Juan | El Castillo Mun. Reserva Indio-Maíz,… | — |
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| Adiantum trichochlaenum Mickel & Beitel | R. M. Rueda 3469 | 24 Feb 1994 | Nicaragua | Región Autónoma del Caribe Sur | Rio Punta Gorda, al este… | — |
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| Alsophila cuspidata (Kunze) D.S.Conant | R. M. Rueda 9715 | 10 Dec 1998 | Nicaragua | Río San Juan | El Castillo Mun. Reserva Indio-Maiz;… | — |
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| Anacardium excelsum (Kunth) Skeels | R. M. Rueda 10508 | 19 Mar 1999 | Nicaragua | Río San Juan | Municipio de el Castillo, Reserva… | — |
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| Anemia phyllitidis (L.) Sw. | R. M. Rueda 12087 | 21 Oct 1999 | Nicaragua | Estelí | Comúnidad San José del Rodeo,… | — |
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| Asplenium achilleifolium (Lam.) C.Chr. | R. M. Rueda 10903 | 17 Apr 1999 | Nicaragua | Estelí | Estelí Mun. Puerto Azules | — |
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| Asplenium serra Langsd. & Fisch. | R. M. Rueda 14957 | 07 Sep 2000 | Nicaragua | Jinotega | Wiwilí de Jinotega Mun. Reserva… | — |
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| Asplenium serratum L. | R. M. Rueda 6118 | 20 Feb 1997 | Nicaragua | Río San Juan | El Castillo Mun. Reserva Indio… | — |
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| Asplenium serratum L. | R. M. Rueda 10564 | 10 Apr 1999 | Nicaragua | Región Autónoma del Caribe Norte | Siuna Mun. Reserva Bosawas, Cerro… | — |
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| Asplenium x coto-brusense A.Rojas & J.M.Chaves | R. M. Rueda 15734 | 12 Jan 2001 | Nicaragua | Jinotega | San José de Bocay Mun.… | — |
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| Austroblechnum lehmannii (Hieron.) Gasper & V.A.O.Dittrich | R. M. Rueda 11285 | 10 Jun 1999 | Nicaragua | Estelí | Estelí Mun. Reserva Natural Miraflor,… | — |
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| Bactris hirta var. pectinata (Mart.) Govaerts | R. M. Rueda 722 | 09 Jul 1992 | Peru | Loreto | Districto Fernando Lores, Tamshiyacu, Constancia. | — |
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| Bazzania schlimiana (Gottsche) Fulford | R. M. Rueda 15760 | 12 Jan 2001 | Nicaragua | — | Jinotega, Municipio de Bocay. Reserva… | — |
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| Bazzania schlimiana (Gottsche) Fulford | R. M. Rueda 4510 | 25 Jul 1996 | Nicaragua | Río San Juan | San Juan del Norte. ,… | — | ||||
| Campyloneurum phyllitidis (L.) C.Presl | R. M. Rueda 14437 | 26 Aug 2000 | Nicaragua | Jinotega | Wiwilí de Jinotega Mun. Reserva… | — |
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| Campyloneurum phyllitidis (L.) C.Presl | R. M. Rueda 5397 | 05 Jan 1997 | Nicaragua | Río San Juan | El Castillo Mun. Reserva Indio-Maiz,… | — |
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| Campylopus subcuspidatus (Hampe) A.Jaeger | R. M. Rueda 8061 | 08 Apr 1998 | Nicaragua | Jinotega | Wiwilí de Jinotega Mun. Zona… | — |
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| Cavendishia axillaris A.C.Sm. | R. M. Rueda 5575 | 08 Jan 1997 | Nicaragua | Río San Juan | El Castillo Mun. Reserva Indio-Maiz;… | — |
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| Clidemia capitellata (Bonpl.) D.Don | R. M. Rueda 704 | 09 Jul 1992 | Peru | Loreto | Distrito Fernando Lores, Tamshiyacu, Constancia.… | — |
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| Conchocarpus toxicarius (Spruce ex Engl.) Kallunki & Pirani | R. M. Rueda 728 | 09 Jul 1992 | Peru | Loreto | Distrito Fernando Lores, Tamshiyacu, Constancia. | — | ||||
| Ctenitis refulgens (Klotzsch ex Mett.) Vareschi | R. M. Rueda 2078 | 17 Jul 1994 | Nicaragua | Río San Juan | Río San Juan, Bosque situado… | — |
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| Cyathea multiflora Sm. | R. M. Rueda 9284 | 30 Nov 1998 | Nicaragua | Río San Juan | El Castillo Mun. Reserva Indio-Maiz,… | — |
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