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| Taxon | Collector | Date | Country | State/Province | Locality | Type Status | Barcode | Notice | ||
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| Asplenium flabellulatum Kunze | A. F. Rojas Alvarado 5070 | 20 Apr 1999 | Costa Rica | Puntarenas | Coto Brus (Canton). Z.P. Las… | — |
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| Gaga harrisii (Maxon) Fay W.Li & Windham | A. F. Rojas Alvarado 5084 | 21 Apr 1999 | Costa Rica | San José | Dota (Canton). R. F. Los… | — |
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| Thelypteris pusilla (Mett.) Ching | A. F. Rojas Alvarado 5089 | 21 Apr 1999 | Costa Rica | Cartago | El Guarco (Canton). Cuenca del… | — |
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| Eriosorus warscewiczii (Mett.) Copel. | A. F. Rojas Alvarado 5083 | 21 Apr 1999 | Costa Rica | Cartago | Paraíso (Canton). R.F. Rio Macho.… | — |
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| Melpomene anfractuosa (Kunze ex Klotzsch) A.R.Sm. & R.C.Moran | A. F. Rojas Alvarado 5082 | 21 Apr 1999 | Costa Rica | Cartago | Paraíso (Canton). R.F. Rio Macho.… | — |
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| Sticherus hypoleucus (Sodiro) Copel. | A. F. Rojas Alvarado 5116 | 23 Apr 1999 | Costa Rica | San José | Moravia (Canton). Cuenca del Sarapiquí.… | — |
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| Thelypteris glandulosa var. brachyodus (Kunze) A.R.Sm. | A. F. Rojas Alvarado 5112 | 23 Apr 1999 | Costa Rica | San José | Vázquez de Coronado (Canton). Cuenca… | — |
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| Megalastrum atrogriseum (C.Chr.) A.R.Sm. & R.C.Moran | A. F. Rojas Alvarado 5100 | 23 Apr 1999 | Costa Rica | San José | Cantón de Vázquez de Coronado,… | — |
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| Gaga cuneata (Link) F.W.Li & Windham | A. F. Rojas Alvarado 5131 | 25 May 1999 | Costa Rica | San José | Desamparados (Canton). Cuenca del Pirris-Damas.… | — |
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| Elaphoglossum glabellum J.Sm. | A. F. Rojas Alvarado 5121 | 25 May 1999 | Costa Rica | San José | Dota (Canton). Cuenca del Pirris-Damas.… | — |
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| Gaga kaulfussii (Kunze) F.W.Li & Windham | A. F. Rojas Alvarado 5134 | 25 May 1999 | Costa Rica | San José | Aserrí (Canton). Cuenca del Pirris-Damas.… | — |
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| Elaphoglossum subcuspidatum Rosenst. | A. F. Rojas Alvarado 5123 | 25 May 1999 | Costa Rica | San José | Dota (Canton). Cuenca del Pirris-Damas.… | — |
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| Elaphoglossum conspersum Christ | A. F. Rojas Alvarado 5122 | 25 May 1999 | Costa Rica | San José | Dota (Canton). Cuenca del Pirris-Damas.… | — |
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| Tectaria athyrioides (Baker) C.Chr. | A. F. Rojas Alvarado 5160 | 14 Jul 1999 | Costa Rica | Limón | Pococí (Canton). P. N. Braulio… | — |
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| Diplazium hians Kunze ex Klotzsch | A. F. Rojas Alvarado 5169 | 14 Jul 1999 | Costa Rica | Heredia | Barva (Canton). Cuenca del Tárcoles.… | — |
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| Diplazium hians Kunze ex Klotzsch | A. F. Rojas Alvarado 5169 | 14 Jul 1999 | Costa Rica | Heredia | Barva (Canton). Cuenca del Tarcoles.… | — |
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| Gaga angustifolia (Kunth) F.W.Li & Windham | A. F. Rojas Alvarado 5165 | 14 Jul 1999 | Costa Rica | Heredia | Barva (Canton). Cuenca del Tárcoles.… | — |
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| Dennstaedtia gracilis A.Rojas & Tejero | A. F. Rojas Alvarado 5376 | 15 May 2000 | Mexico | Hidalgo | Molango de Escamilla Mun. Km.… | isotype |
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| Sphagnum meridense (Hampe) Müll.Hal. | A. F. Rojas Alvarado 5422 | 22 Oct 2000 | Mexico | Puebla | Cuetzalan del Progreso Mun. Cascadas… | — | ||||
| Plagiogyria semicordata (C.Presl) Christ | A. F. Rojas Alvarado 4818 | 15 Dec 2000 | Costa Rica | Alajuela | P.N. Volcan Poas. Cuenca del… | — |
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| Hymenophyllum | A. F. Rojas Alvarado 4816 | 15 Dec 2000 | Costa Rica | Alajuela | P.N. Volcan Poas. Cuenca del… | — |
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| Cyathea x moralesiana A.Rojas | A. F. Rojas Alvarado 7550 | 20 Feb 2007 | Costa Rica | Limón | R.V.S. Barra del Colorado, San… | isotopotype |
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| Cyathea x moralesiana A.Rojas | A. F. Rojas Alvarado 7550 | 20 Feb 2007 | Costa Rica | Limón | R.V.S. Barra del Colorado, San… | isotype |
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| Elaphoglossum micropogon Mickel | M. A. Sundue | A. F. Rojas Alvarado | A. Vasco Gutiérrez 1754 | 04 Feb 2008 | Costa Rica | Cartago | P. N. Tapantí, Carretera ICE,… | — |
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| Elaphoglossum nigrescens (Hook.) T.Moore ex Diels | M. A. Sundue | A. F. Rojas Alvarado | A. Vasco Gutiérrez 1776 | 04 Feb 2008 | Costa Rica | Cartago | P. N. Tapantí, Carretera ICE,… | — |
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