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| Taxon | Collector | Date | Country | State/Province | Locality | Type Status | Barcode | Notice | ||
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| Inonotus hispidus (Bull.:Fr.) P.Karst. | F. Fautrey s.n. | Sep 1897 | France | — | Corrombles, Cote-d'Or | — |
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| Valsa fallax Nitschke | F. Fautrey s.n. | Sep 1891 | France | — | Côte-d'Or | — |
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| Valsa salicina (Pers.) Fr. | F. Fautrey s.n. | Aug 1891 | France | — | Montagne de Charny, Côte-d'Or | — |
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| Valsa salicina (Pers.) Fr. | F. Fautrey s.n. | Jan 1892 | France | — | Noidan | — |
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| Valsa salicina (Pers.) Fr. | F. Fautrey s.n. | Jan 1892 | France | — | Noidan | — |
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| Valsa sepincola Fuckel | F. Fautrey s.n. | Nov 1890 | France | — | "Wood of rocks", à Noidan… | — |
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| Valsa sordida Nitschke | F. Fautrey s.n. | Nov 1890 | France | — | Noidan (Côte-d'Or) | — |
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| Sphaerella pinicola Fautrey | F. Fautrey s.n. | Sep 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Environs d'Epoisses. | syntype |
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| Corticium polygonium Pers. | F. Fautrey s.n. | Feb 1897 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Bois de Vanal. | — |
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| Corticium polygonium Pers. | F. Fautrey s.n. | Feb 1897 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Bois de Vanal. | — |
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| Plasmopara umbelliferarum Unger | F. Fautrey s.n. | Oct 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Bords de l'Armancon | — |
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| Plasmodiophora brassicae Woronin | F. Fautrey s.n. | 30 Sep 1982 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). D. C. Precy | — |
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| Diaporthe conjuncta (Nees) Fuckel | F. Fautrey 5351 | 27 Mar 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Environ de Precy… | — |
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| Dasyscyphus ciliaris (Schrad.) Sacc. | F. Fautrey s.n. | — | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Epoisses. | — |
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| Dasyscyphus ciliaris (Schrad.) Sacc. | F. Fautrey s.n. | — | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Epoisses. | — |
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| Arcyria denudata (L.) Wettst. | F. Fautrey s.n. | Nov 1990 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Fontangy | — | ||||
| Diaporthe dulcamarae Nitschke | F. Fautrey 7016 | Apr 1896 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Montagne de Bard… | — |
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| Diaporthe dulcamarae Nitschke | F. Fautrey 7016 | Apr 1896 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Montagne de Bard… | — |
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| Diaporthe fibrosa (Pers.) Fuckel | F. Fautrey | Ete 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Environs d'Epoises (Cote-d'Or) | — |
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| Uredo abscondita Fautrey | F. Fautrey | Jul 1895 | France | — | isotype | |||||
| Uredo abscondita Fautrey | F. Fautrey | Jul 1895 | France | — | isotype | |||||
| Leptosphaeria sarothamni F.Lamb. & Fautrey | F. Fautrey s.n. | Apr 1893 | France | — | Morvan | isotype |
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| Leptosphaeria sarothamni F.Lamb. & Fautrey | F. Fautrey s.n. | Apr 1893 | France | — | Morvan | isotype |
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| Pistillina rubra Fautrey & Ferry | F. Fautrey | Aug 1892 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). "Côte-d'Or" | possible type |
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| Pistillina rubra Fautrey & Ferry | F. Fautrey | Aug 1892 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). "Côte-d'Or" | possible type |
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